146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0048 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  100 
 
 		 491 aa  978    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  89.92 
 
 		 377 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  99.27 
 
 		 478 aa  823    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  99.76 
 
 		 409 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  54.89 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  58.73 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  58.59 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  49.32 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  55.41 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  48.77 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6138  putative capsule biosynthesis protein  54.45 
 
 		 382 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  53.97 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  52.11 
 
 		 374 aa  361  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  53.28 
 
 		 368 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  56.34 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  51.59 
 
 		 370 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  50.99 
 
 		 380 aa  336  5e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  52.91 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26970  predicted protein  37.9 
 
 		 365 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  34.6 
 
 		 331 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  36.8 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.61 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  34.94 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  34.38 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.74 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.33 
 
 		 390 aa  117  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3091  poly-gamma-glutamate synthesis protein  51.35 
 
 		 120 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  30.42 
 
 		 358 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  32.78 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  32 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  32.04 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  32.25 
 
 		 351 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.48 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.96 
 
 		 348 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  36.87 
 
 		 1584 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  32.38 
 
 		 340 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  35.37 
 
 		 1020 aa  96.7  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  25.83 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  30.14 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  26.32 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  25.83 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  26.47 
 
 		 367 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  26.75 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  25.46 
 
 		 367 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  25.46 
 
 		 367 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  25.46 
 
 		 367 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.95 
 
 		 360 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  25.46 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  29.09 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.71 
 
 		 588 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  25.88 
 
 		 367 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.31 
 
 		 342 aa  90.1  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  32.72 
 
 		 378 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  32.7 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.62 
 
 		 356 aa  87.4  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.43 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  23.6 
 
 		 411 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.66 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  30.43 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  33.01 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  29.47 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.23 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.68 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  29.66 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  32.6 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.63 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.63 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.55 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.64 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  31.98 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  28 
 
 		 672 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.6 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  27.17 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  30.29 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  24.6 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.33 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  28.19 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  31.96 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  30.73 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  27.2 
 
 		 360 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  24.85 
 
 		 710 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.13 
 
 		 607 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.35 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  25.74 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  24.2 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  29.76 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.11 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  23.98 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  20.73 
 
 		 450 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  26.46 
 
 		 330 aa  67  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4665  Mur ligase, middle region  30.41 
 
 		 851 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.69 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.69 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4753  Mur ligase middle domain-containing protein  30.41 
 
 		 1299 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  24.19 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  27.01 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>