149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0506 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  100 
 
 
325 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  41.05 
 
 
327 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  37.96 
 
 
324 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  38.99 
 
 
338 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  38.99 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  36.98 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  37.31 
 
 
390 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  37.97 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  36.62 
 
 
365 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  33.33 
 
 
351 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.08 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  31.4 
 
 
349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  33.44 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  31.42 
 
 
370 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  35.29 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.31 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  33.47 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  37.72 
 
 
370 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  31.6 
 
 
367 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  32.02 
 
 
478 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  30.4 
 
 
367 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  36.4 
 
 
378 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  30 
 
 
367 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  30.4 
 
 
367 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  32.49 
 
 
1020 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  31.75 
 
 
409 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  31.74 
 
 
491 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  35.51 
 
 
370 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  32.53 
 
 
420 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  29.2 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  35.74 
 
 
536 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  34.9 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  28.8 
 
 
367 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  28.4 
 
 
367 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  28.4 
 
 
367 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  31 
 
 
398 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  28.4 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  28 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  29.63 
 
 
375 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.41 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6138  putative capsule biosynthesis protein  32.11 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608597  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.45 
 
 
360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  31.13 
 
 
377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  28.46 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.92 
 
 
588 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  34.01 
 
 
342 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  34.4 
 
 
383 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  30.49 
 
 
380 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  32.43 
 
 
390 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  31.97 
 
 
431 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  34.01 
 
 
368 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.81 
 
 
405 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.65 
 
 
397 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  33.77 
 
 
360 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.79 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  30.35 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  32.93 
 
 
365 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.66 
 
 
396 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.37 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  32.66 
 
 
379 aa  95.9  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.6 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  33.09 
 
 
373 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  32.71 
 
 
366 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.39 
 
 
328 aa  92.4  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  31.62 
 
 
1584 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  33.45 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.82 
 
 
379 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  31.48 
 
 
372 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  27.27 
 
 
710 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  25.67 
 
 
387 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  24.9 
 
 
422 aa  89.7  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  32.38 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  34.22 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  31.1 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.07 
 
 
369 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  31.34 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  26.32 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.87 
 
 
369 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.69 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  28.39 
 
 
672 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  30.88 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2688  hypothetical protein  24.1 
 
 
712 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  27.97 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.04 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  28.85 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35.4 
 
 
493 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.38 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.94 
 
 
450 aa  79.3  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35.4 
 
 
493 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3333  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.13 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  24.68 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2477  CapA family protein  26.54 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.89 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.72 
 
 
418 aa  77  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  33.62 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4972  Capsule synthesis protein, CapA  40.31 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  20.12 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  27.87 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.12 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>