142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11420 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  100 
 
 
450 aa  915    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  42.14 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  36.29 
 
 
379 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3638  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  32.9 
 
 
403 aa  152  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2458  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  33.92 
 
 
440 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  30.03 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1536  Capsule synthesis protein, CapA  32.57 
 
 
429 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366141  normal  0.237354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  30.82 
 
 
422 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  27.69 
 
 
361 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.79 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  29.88 
 
 
396 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2622  Capsule synthesis protein, CapA  34.49 
 
 
380 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.33 
 
 
429 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.23 
 
 
397 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.17 
 
 
392 aa  123  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  28.98 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  29.49 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.9 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  28.98 
 
 
411 aa  120  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1235  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  34.07 
 
 
455 aa  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  30.83 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  30.35 
 
 
395 aa  114  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  28.8 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.59 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  30.26 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  30.99 
 
 
388 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.08 
 
 
493 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1917  CapA domain-containing protein  24.35 
 
 
404 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.011599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  24.35 
 
 
404 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  27.51 
 
 
362 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.31 
 
 
464 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  31.58 
 
 
358 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.86 
 
 
493 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1688  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.67 
 
 
447 aa  103  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  29.94 
 
 
466 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30 
 
 
324 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.34 
 
 
411 aa  99.8  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.82 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  27.12 
 
 
536 aa  93.6  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.25 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  28.27 
 
 
377 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2038  hypothetical protein  25.63 
 
 
420 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000700253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  29.03 
 
 
378 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01300  capsule synthesis protein PGA_cap  25.87 
 
 
503 aa  87.8  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.51 
 
 
342 aa  87.8  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  28.57 
 
 
411 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.65 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  28.1 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  29.67 
 
 
373 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.51 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  25.39 
 
 
338 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.29 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.92 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.62 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  26.78 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.3 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  28.71 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.86 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.12 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  26.72 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  28.99 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  27.31 
 
 
364 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  24.22 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  26.69 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  26.22 
 
 
346 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.26 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  27.71 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  25.94 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  25.89 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.09 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  29.26 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  26.09 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.44 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0760  hypothetical protein  24.48 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718569  hitchhiker  2.13872e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  22.62 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  26.96 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  30.26 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  24.43 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4946  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  24.66 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0814916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  26.25 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  26.67 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.34 
 
 
607 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.64 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  28.06 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  23.98 
 
 
491 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  24.1 
 
 
350 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  23.84 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  23.87 
 
 
377 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  25.09 
 
 
321 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.89 
 
 
327 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  27.6 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  26.23 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  23.98 
 
 
409 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  26.56 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  25.36 
 
 
373 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  24.93 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  24.37 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  24.31 
 
 
365 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  21.47 
 
 
395 aa  64.3  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>