127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3333 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3333  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  100 
 
 
352 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.13 
 
 
360 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  29.81 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.49 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  33.33 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.24 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.62 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  23.83 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.79 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  24.34 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  24.57 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  24.57 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  28.85 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  24.23 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.84 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  27.8 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  24.57 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  24.01 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  24.57 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  24.01 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  23.68 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.16 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  30.33 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3652  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.44 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103704  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0698  Capsule synthesis protein, CapA  27.27 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.84 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  30.27 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.9 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  27.03 
 
 
378 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  26.87 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.13 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.86 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  28.84 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.51 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.71 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.94 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  27.53 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  27.17 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.61 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.23 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  26.97 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  30 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.08 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  27.15 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  28.9 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  24.02 
 
 
411 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  28.43 
 
 
536 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  23.46 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  23.46 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.06 
 
 
429 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.7 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  24.86 
 
 
418 aa  62.8  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  25.08 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  26.64 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.37 
 
 
415 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  31.61 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2477  CapA family protein  23.91 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1951  hypothetical protein  28.57 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  27.88 
 
 
327 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.7 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.1 
 
 
450 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.75 
 
 
588 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4946  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.42 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0814916  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  29.88 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  26.67 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  28.9 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  26.46 
 
 
1584 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6386  Capsule synthesis protein, CapA  35.8 
 
 
845 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175957  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3999  Capsule synthesis protein, CapA  37.04 
 
 
449 aa  56.2  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0396426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  36.59 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2035  CapA family protein  24.51 
 
 
384 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0211653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.56 
 
 
607 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0806  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.95 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207843  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  26.67 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  21.35 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  37.66 
 
 
462 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  24.02 
 
 
422 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  27.32 
 
 
450 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  26.94 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  21.11 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.99 
 
 
375 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  26.64 
 
 
420 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3228  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  34.04 
 
 
448 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.992169  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  21.32 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  24.23 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  34.41 
 
 
373 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  29.95 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4753  Mur ligase middle domain-containing protein  25.1 
 
 
1299 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  35.44 
 
 
372 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4760  hypothetical protein  26.26 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124071  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.29 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4665  Mur ligase, middle region  25.1 
 
 
851 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  24.63 
 
 
1020 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  26.53 
 
 
373 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.2 
 
 
383 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.11 
 
 
405 aa  49.7  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  25.24 
 
 
365 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  25.59 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  22.78 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  27.22 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>