156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3556 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  84.05 
 
 		 372 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  76.02 
 
 		 372 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  44.13 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  37.17 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  34.89 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  40.17 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.71 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  34.2 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  35.21 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  29.1 
 
 		 536 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  29.29 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  28.33 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  29.29 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  24.93 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  24.93 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  24.68 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  24.93 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  27.92 
 
 		 367 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  27.92 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  28.87 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.78 
 
 		 588 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  28.63 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  33.57 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.15 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  36.73 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2656  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.21 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35.74 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.58 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.75 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.35 
 
 		 331 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.99 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  34.27 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.77 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.92 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  35.34 
 
 		 466 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.46 
 
 		 420 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  31.84 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3228  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.57 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.992169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.87 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  26.56 
 
 		 450 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3999  Capsule synthesis protein, CapA  26.14 
 
 		 449 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0396426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  27.88 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  27.98 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.84 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  23.91 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.46 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.88 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.5 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  23.38 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3117  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.1 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.96 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  26.44 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  33.33 
 
 		 491 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  28.57 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 478 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  29.75 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.5 
 
 		 375 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  33.06 
 
 		 474 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  31.41 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.63 
 
 		 324 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  28.35 
 
 		 397 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.6 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  22.68 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  31.36 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5041  hypothetical protein  27.66 
 
 		 412 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.27 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  29.92 
 
 		 672 aa  86.7  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.47 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5412  hypothetical protein  27.38 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264785 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  26.83 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  29.44 
 
 		 1020 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  23.63 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.39 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  28.75 
 
 		 1584 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4972  Capsule synthesis protein, CapA  31.65 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  25.94 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0220  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.15 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  26.32 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  26.72 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  24.9 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2279  hypothetical protein  28.26 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.66 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  33.99 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  33.01 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  24.2 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  24.57 
 
 		 464 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  21.15 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  32.99 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1951  hypothetical protein  28.78 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  22.86 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  28.21 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  22.86 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  22.64 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  26.76 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  22.86 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  23.63 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  26.41 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1917  CapA domain-containing protein  21.15 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.011599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>