157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7265 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  857    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  72.56 
 
 
405 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  56.29 
 
 
377 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  56.76 
 
 
365 aa  349  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  53.62 
 
 
366 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  53.96 
 
 
360 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  50.46 
 
 
378 aa  296  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.4 
 
 
383 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  50.32 
 
 
373 aa  272  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  49.85 
 
 
379 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  31.89 
 
 
367 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  32.2 
 
 
367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  32.79 
 
 
367 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  31.58 
 
 
367 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  31.89 
 
 
367 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  31.58 
 
 
367 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  31.89 
 
 
367 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  31.89 
 
 
367 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  32.14 
 
 
367 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  30.96 
 
 
367 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  34.47 
 
 
374 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  37.29 
 
 
420 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  33.11 
 
 
337 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  36.03 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  38.5 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.17 
 
 
342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  33.12 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.38 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  32.69 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.21 
 
 
356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  37.22 
 
 
493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  37.22 
 
 
493 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.32 
 
 
588 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  30.23 
 
 
536 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  32.63 
 
 
411 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4972  Capsule synthesis protein, CapA  38.11 
 
 
389 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  30.29 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.79 
 
 
331 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.78 
 
 
348 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  37.27 
 
 
466 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.66 
 
 
324 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  29.25 
 
 
422 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.19 
 
 
411 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  31.65 
 
 
340 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.27 
 
 
346 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.41 
 
 
360 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  30.67 
 
 
1020 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  28.91 
 
 
397 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  31.18 
 
 
395 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.33 
 
 
327 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  36.07 
 
 
474 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.42 
 
 
369 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  25.25 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.29 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.69 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  28.7 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  30.04 
 
 
360 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  30.51 
 
 
1584 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  31.47 
 
 
405 aa  94  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.97 
 
 
325 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  27.83 
 
 
411 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  29.96 
 
 
710 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  25.77 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  31.6 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  31.07 
 
 
375 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  26.93 
 
 
327 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.4 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  31.77 
 
 
346 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.57 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  33.01 
 
 
491 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  33.64 
 
 
370 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  30.74 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  33.04 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  33.01 
 
 
478 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.55 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3638  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.57 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  33.01 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  32.86 
 
 
370 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  31.3 
 
 
364 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.79 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  29.63 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  27.94 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.83 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.02 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  28.15 
 
 
362 aa  84  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.8 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  26.5 
 
 
672 aa  83.2  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  30.22 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  26.72 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  29.72 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.98 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.79 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  31.1 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.43 
 
 
377 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  26.9 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  25.58 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  27.76 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  21.67 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  29.32 
 
 
370 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  29.72 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>