157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  100 
 
 
379 aa  756    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2622  Capsule synthesis protein, CapA  44.59 
 
 
380 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3638  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  47.06 
 
 
403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  38.18 
 
 
361 aa  235  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1536  Capsule synthesis protein, CapA  45.94 
 
 
429 aa  210  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366141  normal  0.237354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2458  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  40.2 
 
 
440 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  36.6 
 
 
450 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1235  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  40.53 
 
 
455 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.02 
 
 
392 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  38.39 
 
 
462 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  34.24 
 
 
362 aa  178  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  36.62 
 
 
395 aa  176  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  35.44 
 
 
392 aa  176  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.03 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  29.54 
 
 
411 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.08 
 
 
397 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  31.15 
 
 
411 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2038  hypothetical protein  34.12 
 
 
420 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000700253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  31.15 
 
 
411 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1688  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  34.11 
 
 
447 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  35.5 
 
 
330 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  37.25 
 
 
429 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  29.68 
 
 
422 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  29.6 
 
 
450 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  31.1 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1917  CapA domain-containing protein  31.72 
 
 
404 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.011599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  31.39 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  31.49 
 
 
379 aa  139  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  28.87 
 
 
392 aa  133  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  33.76 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  33.24 
 
 
474 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  27.52 
 
 
329 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.92 
 
 
418 aa  123  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.61 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  31.89 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  28.27 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  33.23 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.91 
 
 
493 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  27.08 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  33.33 
 
 
466 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  30.65 
 
 
365 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.23 
 
 
369 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6483  hypothetical protein  31.34 
 
 
501 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  25.47 
 
 
411 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.49 
 
 
360 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  33.65 
 
 
349 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  25.16 
 
 
367 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  29.78 
 
 
378 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  23.17 
 
 
415 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  27.52 
 
 
360 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  26.47 
 
 
367 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  24.65 
 
 
367 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  25.49 
 
 
367 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  25.49 
 
 
367 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  25.16 
 
 
367 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  29.07 
 
 
340 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.78 
 
 
342 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.97 
 
 
356 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  25.16 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.71 
 
 
464 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01300  capsule synthesis protein PGA_cap  30 
 
 
503 aa  96.7  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  24.65 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  33.8 
 
 
397 aa  96.3  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  24.51 
 
 
367 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  28.66 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  27.57 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.85 
 
 
314 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.2 
 
 
348 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  24.48 
 
 
350 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.05 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  27.67 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4946  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.09 
 
 
440 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0814916  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.21 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.63 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  28.09 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  30 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  28.98 
 
 
1020 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  33.48 
 
 
672 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.71 
 
 
331 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  30.14 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.95 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.91 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  27.8 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  31.11 
 
 
327 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.67 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  27.85 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  25.94 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  33.05 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  26.45 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  30.89 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  30.08 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  29.39 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.26 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  33.91 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  26.36 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  26.37 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  26.28 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  29.73 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  31.61 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  31.48 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>