134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2458 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2458  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  100 
 
 
440 aa  884    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1536  Capsule synthesis protein, CapA  46.53 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366141  normal  0.237354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1235  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  48.91 
 
 
455 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  39.19 
 
 
379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3638  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  33.9 
 
 
403 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.11 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  32.68 
 
 
450 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.53 
 
 
361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2622  Capsule synthesis protein, CapA  40.59 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.33 
 
 
396 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  32.89 
 
 
362 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  34.15 
 
 
450 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  32.14 
 
 
392 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  31.61 
 
 
395 aa  144  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1917  CapA domain-containing protein  26.44 
 
 
404 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.011599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  26.7 
 
 
404 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2038  hypothetical protein  35.06 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000700253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.3 
 
 
429 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  28.72 
 
 
411 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  31.63 
 
 
330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.61 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  28.72 
 
 
411 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  28.38 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  34.06 
 
 
462 aa  124  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  24.59 
 
 
422 aa  123  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  28.16 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1688  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.84 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  29.9 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  26.73 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.9 
 
 
418 aa  113  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  32.57 
 
 
466 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01300  capsule synthesis protein PGA_cap  29.34 
 
 
503 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.94 
 
 
493 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.52 
 
 
493 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  25.09 
 
 
329 aa  97.1  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.62 
 
 
474 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  29 
 
 
536 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.57 
 
 
342 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  26.92 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.55 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  26.35 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  26.12 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  32.14 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  24.39 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  25.86 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  29.03 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  23.03 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  27.02 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  24.16 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  29.95 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.82 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  28.4 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  26.02 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  27.6 
 
 
358 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  20.98 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  23.61 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  28.78 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.13 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.3 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  23.53 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  25 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  23.96 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  28.44 
 
 
351 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  22.73 
 
 
367 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  22.73 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  22.73 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  23.88 
 
 
367 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  22.73 
 
 
367 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  22.42 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  28.57 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  29.11 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6483  hypothetical protein  26.69 
 
 
501 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  25.73 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  26.49 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4946  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.7 
 
 
440 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0814916  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  27.27 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  24.81 
 
 
328 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.99 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  25.81 
 
 
346 aa  63.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.69 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  26.59 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  25.81 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  26.53 
 
 
372 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.15 
 
 
360 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  26.94 
 
 
672 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.71 
 
 
588 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  27.94 
 
 
431 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  27.5 
 
 
372 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  27.36 
 
 
1584 aa  60.1  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  35.4 
 
 
405 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  24.45 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0760  hypothetical protein  22.36 
 
 
363 aa  58.9  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718569  hitchhiker  2.13872e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  25.11 
 
 
338 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  30.25 
 
 
364 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.5 
 
 
365 aa  57.4  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  26.43 
 
 
370 aa  57  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  21.93 
 
 
607 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  26.44 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  26.38 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>