99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1500 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1500  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  897    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0760  hypothetical protein  42.43 
 
 		 363 aa  275  9e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718569  hitchhiker  2.13872e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.53 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  27.03 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  27.19 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  29.26 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  29.82 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  24.38 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.09 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.32 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  25.78 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  23.61 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  27.27 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  26.19 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.88 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.42 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.42 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  25.22 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  24.37 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  24.92 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  27.98 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  24.14 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  26.19 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.21 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.6 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  22.74 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  24.03 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  26.25 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  24.81 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  26.78 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1917  CapA domain-containing protein  24.38 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.011599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  25.62 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  24.23 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  24.13 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.94 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  25.87 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  25.48 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1536  Capsule synthesis protein, CapA  24.4 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366141  normal  0.237354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  23.44 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  25.62 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  26 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  22.71 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2622  Capsule synthesis protein, CapA  22.18 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  25.68 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.7 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  23.39 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.16 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  24.27 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  23.47 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  24.27 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  24.27 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  24.27 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  24.15 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  23.84 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4946  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.49 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0814916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  22.13 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  24.91 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  24.49 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  24.9 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1235  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  24.17 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  27.34 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2477  CapA family protein  24.2 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.79 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  21.05 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  23.97 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2458  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  21.85 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  23.35 
 
 		 672 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  22.58 
 
 		 536 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  22.53 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.24 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  21.99 
 
 		 328 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  23.14 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  25.32 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  22.63 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24 
 
 		 360 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01300  capsule synthesis protein PGA_cap  23.89 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  23.22 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  22.39 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  27.27 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.27 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  24.14 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  27.09 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  24.16 
 
 		 710 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  20.08 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  24.89 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  22.56 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1688  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  19.85 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  23.85 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  24.34 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4760  hypothetical protein  32.67 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124071  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  22.49 
 
 		 1020 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  25.32 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  22.27 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  21.1 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  20.99 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4972  Capsule synthesis protein, CapA  22.86 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  21.93 
 
 		 327 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  20.07 
 
 		 365 aa  43.5  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  23.74 
 
 		 378 aa  43.5  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>