More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1425 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1425  transport system permease protein  100 
 
 
345 aa  645    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  38.94 
 
 
354 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  40 
 
 
348 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  40 
 
 
348 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  39.73 
 
 
348 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  40.32 
 
 
357 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  38.63 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  38 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  39.23 
 
 
356 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  38.24 
 
 
358 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  37.67 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  40.2 
 
 
357 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  37.5 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  38.28 
 
 
355 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  36.22 
 
 
359 aa  192  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  36.71 
 
 
349 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  36.57 
 
 
357 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.89 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  39.63 
 
 
356 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  34.63 
 
 
373 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.96 
 
 
336 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1284  transport system permease protein  43.51 
 
 
338 aa  177  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.601831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  38.6 
 
 
355 aa  177  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  37.25 
 
 
346 aa  176  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  37.54 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  33.89 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  39.55 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  36.52 
 
 
359 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  37.82 
 
 
363 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  36.3 
 
 
357 aa  169  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  37.91 
 
 
350 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  33.9 
 
 
367 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  34.95 
 
 
374 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  36.22 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  36.49 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  38.6 
 
 
371 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  36.65 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.73 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  37.54 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  37.24 
 
 
360 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  37.23 
 
 
356 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  36.23 
 
 
356 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  37.74 
 
 
360 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  34.92 
 
 
378 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  33.22 
 
 
347 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  34.08 
 
 
354 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  31.61 
 
 
331 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  34.53 
 
 
323 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  32.92 
 
 
361 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  36.07 
 
 
369 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  35.36 
 
 
356 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  39.2 
 
 
359 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  38.89 
 
 
359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  37.22 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  39.2 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  37.93 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  32.28 
 
 
347 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  36.42 
 
 
360 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  38.89 
 
 
359 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  36.9 
 
 
360 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  38.89 
 
 
359 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  36.57 
 
 
330 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  38.64 
 
 
365 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  39.54 
 
 
352 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  35.35 
 
 
372 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  36 
 
 
352 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  36.76 
 
 
360 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  35.66 
 
 
315 aa  149  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  37.38 
 
 
318 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  36 
 
 
352 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  37.05 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  35.89 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  36.08 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.99 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  37.5 
 
 
360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  37.5 
 
 
360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 
338 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  37.5 
 
 
353 aa  146  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 
338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
342 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  32.06 
 
 
338 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  32.06 
 
 
338 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 
338 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
338 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  32.06 
 
 
338 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 
342 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  32.06 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  33.55 
 
 
342 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  33.22 
 
 
342 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  33.88 
 
 
342 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  32.25 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  33.55 
 
 
345 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  33.55 
 
 
345 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.24 
 
 
360 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
342 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  30.21 
 
 
319 aa  143  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  36.55 
 
 
363 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>