90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3167 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  100 
 
 		 140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  56.1 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  57.98 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  52.94 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  52.94 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  51.94 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  50.38 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  51.26 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  51.2 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  51.2 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  51.2 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 168 aa  126  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  48.41 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 138 aa  119  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  46.83 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  48.51 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  43.9 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  50.82 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  42.4 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  39.84 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  46.4 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 163 aa  90.1  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  34 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 256 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  31.48 
 
 		 238 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2558  two-component response regulator  28.71 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0562  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  32.67 
 
 		 238 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4637  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3655  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4952  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  0.89803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4949  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4956  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.211871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5008  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4849  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4922  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000490343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5012  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04242  hypothetical protein  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.889846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3596  two component transcriptional regulator, winged helix family  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0786  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00933  two-component response regulator  27 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04277  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ArcB or CpxA  29 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1947  two-component response regulator  29 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000743409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0650  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223196  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3988  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0651  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000404261  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0777  two-component response regulator  30.28 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000399592  decreased coverage  0.000157294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  32.99 
 
 		 242 aa  42  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0678  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000157437  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3371  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  28 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3606  two-component response regulator  29.41 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0811  two-component response regulator  29.41 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004461  aerobic respiration control protein ArcA  26 
 
 		 238 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000105121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3762  two-component response regulator  30.28 
 
 		 239 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0487627  decreased coverage  0.0000265862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3865  two-component response regulator  30.53 
 
 		 238 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000288449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3671  two-component response regulator  30.53 
 
 		 238 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0601  two-component response regulator  32.97 
 
 		 238 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000457476  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3660  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0335884  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3842  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000808868  hitchhiker  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0733  two-component response regulator  30.28 
 
 		 238 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.318798  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0681  two-component response regulator  29.41 
 
 		 238 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000276194  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0713  two-component response regulator  30.26 
 
 		 238 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3719  two-component response regulator  29.36 
 
 		 238 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000224737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1992  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0815  two-component response regulator  31.87 
 
 		 239 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000717024  decreased coverage  0.00000744043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0531  two-component response regulator  30.53 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1195  two-component response regulator  25.74 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 252 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3478  two-component response regulator  28.43 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.12 
 
 		 242 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0570  two-component response regulator  30.39 
 
 		 238 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  34.41 
 
 		 245 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  29.52 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2984  two-component response regulator  31.87 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  33.98 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0533  two-component response regulator  31.87 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2740  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 231 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307567  normal  0.0284463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  33.98 
 
 		 253 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>