33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2678 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  273  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  73.95 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  68.94 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  63.2 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  59.71 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  58.4 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  55.88 
 
 		 140 aa  156  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  58.2 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  54.92 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  54.03 
 
 		 139 aa  143  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  49.22 
 
 		 136 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  50.72 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  46.03 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  47.62 
 
 		 135 aa  127  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  48.46 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  45.74 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  49.55 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  42.75 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  44 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  48.41 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  25.19 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  24.43 
 
 		 238 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>