34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0965 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  269  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  60.66 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  60.98 
 
 		 132 aa  157  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  58.91 
 
 		 139 aa  157  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  57.58 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  57.94 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  58.2 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  58.87 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  60 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  58.27 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  55.83 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  51.61 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  52.07 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  56.07 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  47.58 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  50.39 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  44.7 
 
 		 163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  53.23 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  50.81 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  52.03 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  45.45 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  31.25 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 492 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.77 
 
 		 234 aa  40  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>