57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2074 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  269  9e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  58.46 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  52.63 
 
 		 139 aa  146  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  69.77 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  60.87 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  53.49 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  53.68 
 
 		 139 aa  137  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  55.22 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  52.89 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  63.93 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  48.8 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  52.68 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  45.67 
 
 		 136 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  46.34 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  42.74 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  45.45 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  42.28 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.63 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.26 
 
 		 242 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  28.68 
 
 		 233 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 1141 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 279 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.73 
 
 		 457 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.9 
 
 		 737 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1854  DNA-binding response regulator  20.83 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 228 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  25.21 
 
 		 237 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  28.68 
 
 		 233 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 962 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  29.51 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  29.51 
 
 		 260 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 260 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  32 
 
 		 258 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1155 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 934 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  25.21 
 
 		 237 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  25.21 
 
 		 237 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  25.21 
 
 		 237 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 374 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  27.91 
 
 		 233 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>