34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1445 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  100 
 
 		 139 aa  279  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  55.8 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  57.46 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  50 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  51.88 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  53.68 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  50 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  50 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  50 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  48.46 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  51.94 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  49.61 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  44.8 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  45.16 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  39.26 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  45.45 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1147  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 841 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 236 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 221 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>