63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1297 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  259  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  73.81 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  72.8 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  70.97 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  65.12 
 
 		 146 aa  176  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  59.38 
 
 		 139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  63.2 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  63.11 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  56.56 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  53.28 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  139  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  56 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  49.59 
 
 		 136 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  52.46 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  51.38 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  48.36 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  46.22 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  45.83 
 
 		 131 aa  106  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  50 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.77 
 
 		 224 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0035  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 236 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal  0.306601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1992  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.84 
 
 		 227 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0390  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.14 
 
 		 237 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0687003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0703  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 237 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  42.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  31.45 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  25.6 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 246 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0709  two component transcriptional regulator  36.46 
 
 		 237 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 246 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 246 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0723  two component transcriptional regulator  36.46 
 
 		 237 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244444 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 246 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 246 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  33.33 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  24.8 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  30.08 
 
 		 246 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2404  two component transcriptional regulator  29.6 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  30.65 
 
 		 238 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  29.89 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 246 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  29.89 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3881  winged helix family two component transcriptional regulator  32.53 
 
 		 237 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.02 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 233 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.75 
 
 		 246 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>