42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3529 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  259  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  92.37 
 
 		 131 aa  245  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  43.85 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  46.51 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  43.31 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  43.31 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  43.31 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  44 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  43.55 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  39.02 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  48.39 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  43.09 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  43.33 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 146 aa  95.9  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  45 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  36.51 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  27.87 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  27.05 
 
 		 231 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  27.05 
 
 		 231 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  27.05 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  33.33 
 
 		 245 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  27.05 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  27.05 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  27.05 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3669  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 373 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  27.87 
 
 		 231 aa  40  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  27.87 
 
 		 231 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>