35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1023 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  100 
 
 		 143 aa  287  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  75 
 
 		 146 aa  217  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  73.11 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  66.94 
 
 		 132 aa  181  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  63.2 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  60.66 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  52.94 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  51.97 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  51.97 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  51.97 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  53.6 
 
 		 136 aa  143  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  49.62 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  53.6 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  48.82 
 
 		 133 aa  141  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  53.28 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  49.59 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  50 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  55.05 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  49.6 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  52.89 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  48.74 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  48.09 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  44.26 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  106  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  29.79 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3569  DNA-binding response regulator CreB  29.79 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 		 380 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5485  DNA-binding response regulator CreB  29.79 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.631221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>