31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0993 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  100 
 
 		 463 aa  886    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  33.97 
 
 		 469 aa  206  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  29.69 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  26.87 
 
 		 457 aa  150  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  27.61 
 
 		 456 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  28.27 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  26.15 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  27.61 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  28.36 
 
 		 484 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  29.16 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  28.66 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  26.42 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  26.44 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  26.04 
 
 		 457 aa  133  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  26.14 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  25.74 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  25.71 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  27.25 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  26.46 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  24.21 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  25.05 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  27.25 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  22.56 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  25.27 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  24.3 
 
 		 456 aa  113  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  30.6 
 
 		 458 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  24.35 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  28.21 
 
 		 606 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  23.6 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  22.47 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  21.96 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>