32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4161 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  76.75 
 
 		 456 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  78.51 
 
 		 456 aa  724    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  900    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  78.51 
 
 		 456 aa  706    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  67.32 
 
 		 456 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  63.16 
 
 		 457 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  65.13 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  64.69 
 
 		 457 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  59.52 
 
 		 457 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  56.67 
 
 		 457 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  55.04 
 
 		 456 aa  501  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  59.08 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  57.46 
 
 		 456 aa  488  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  53.95 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  52.41 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  53.29 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  48.9 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  48.9 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  47.7 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  46.49 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  42.42 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  37.2 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  29.16 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  29.53 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  29.74 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  25.16 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  26.08 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  25 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  25.99 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  28.53 
 
 		 606 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  25.81 
 
 		 458 aa  97.1  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  24.75 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>