30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1422 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  905    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  27.71 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  26.46 
 
 		 455 aa  128  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  25.93 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  25.18 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  25.93 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  25.84 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  25.63 
 
 		 484 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  26.71 
 
 		 456 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  28.66 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  26.76 
 
 		 456 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  25.85 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  25.81 
 
 		 456 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  23.96 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  27.01 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  25.9 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  21.67 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  22.63 
 
 		 456 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  24.65 
 
 		 457 aa  87  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  23.73 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  24.1 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  24.09 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  23.2 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  23.28 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  23.52 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  23.94 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  24.7 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  25.9 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  23.4 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  24.38 
 
 		 606 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>