32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5540 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  100 
 
 		 457 aa  895    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  73.74 
 
 		 457 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  74.84 
 
 		 457 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  56.67 
 
 		 456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  56.89 
 
 		 456 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  56.46 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  54.27 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  55.58 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  54.49 
 
 		 456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  52.95 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  50.33 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  49.56 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  49.67 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  51.42 
 
 		 456 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  51.42 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  49.67 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  50.11 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  50.33 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  46.39 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  44.42 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  38.6 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  32.83 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  27.71 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  28.18 
 
 		 484 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  28.39 
 
 		 484 aa  163  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  27.96 
 
 		 376 aa  121  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  28.65 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  25.38 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  25.6 
 
 		 463 aa  106  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  24.16 
 
 		 458 aa  90.5  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  24.68 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  27.64 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>