32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1037 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  74.84 
 
 
457 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  79.87 
 
 
457 aa  691    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  100 
 
 
457 aa  900    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  60.61 
 
 
456 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  59.52 
 
 
456 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  60.39 
 
 
456 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  56.89 
 
 
456 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  59.52 
 
 
456 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  52.52 
 
 
457 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  53.83 
 
 
456 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  50.77 
 
 
458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  53.39 
 
 
456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  50 
 
 
456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  51.42 
 
 
456 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  51.42 
 
 
456 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  51.42 
 
 
457 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  51.42 
 
 
457 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  47.48 
 
 
455 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  45.95 
 
 
456 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  47.7 
 
 
459 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  39.04 
 
 
456 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  35.37 
 
 
457 aa  216  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  28.35 
 
 
460 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  28.69 
 
 
484 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  28.69 
 
 
484 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  28.23 
 
 
376 aa  127  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  26.87 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  26.92 
 
 
464 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  25.78 
 
 
469 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  28.74 
 
 
606 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  24.88 
 
 
458 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  26.61 
 
 
465 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>