28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1620 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  100 
 
 		 464 aa  904    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  28.76 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  26.35 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  23.72 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  25.92 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  27.06 
 
 		 457 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  24.77 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  24.68 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  25.32 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  24.63 
 
 		 456 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  24.69 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  26.41 
 
 		 456 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  28.41 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  25.93 
 
 		 456 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  25.21 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  21.54 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  22.64 
 
 		 469 aa  87  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  27.47 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  20.65 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  26.82 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  22.71 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  21.84 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  23.86 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  23.86 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  23.45 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  22.54 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  20.5 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  20.29 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>