32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2669 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  100 
 
 
457 aa  886    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  38.78 
 
 
456 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  37.88 
 
 
456 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  38.13 
 
 
456 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  37.2 
 
 
456 aa  262  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  37.88 
 
 
456 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  36.4 
 
 
457 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  35.37 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  32.82 
 
 
458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  34.64 
 
 
459 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  35.15 
 
 
456 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  36.36 
 
 
456 aa  240  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  36.45 
 
 
457 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  32.59 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  35.08 
 
 
456 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  33.26 
 
 
456 aa  228  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  32.61 
 
 
455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  36.4 
 
 
457 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  36.4 
 
 
457 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  34.42 
 
 
456 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  31.67 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  32.69 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  29.85 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  30.49 
 
 
484 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  29.76 
 
 
484 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  28.12 
 
 
469 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  30.15 
 
 
606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  27.41 
 
 
376 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  23.92 
 
 
463 aa  107  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  22.89 
 
 
458 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  26.5 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  23.98 
 
 
465 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>