32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0767 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  73.74 
 
 		 457 aa  663    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  100 
 
 		 457 aa  892    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  79.87 
 
 		 457 aa  714    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  59.08 
 
 		 456 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  58.86 
 
 		 456 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  57.11 
 
 		 456 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  58.64 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  57.99 
 
 		 456 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  56.46 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  53.61 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  55.8 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  51.97 
 
 		 456 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  47.7 
 
 		 458 aa  428  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  50.55 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  51.86 
 
 		 456 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  49.67 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  51.2 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  47.26 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  50.98 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  47.7 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  39 
 
 		 456 aa  329  7e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  36.9 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  28.63 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  29.76 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  29.57 
 
 		 484 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 606 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  27.93 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  26.1 
 
 		 463 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  22.25 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  23.2 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  27.2 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>