33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24560 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  96.27 
 
 		 456 aa  824    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  890    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  54.61 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  55.26 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  54.39 
 
 		 456 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  53.29 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  53.95 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  53.73 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  51.42 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  53.39 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  51.42 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  52.63 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  53.07 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  51.86 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  49.23 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  49.02 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  48.57 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  52.19 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  50.44 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  49.34 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  41.89 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  35.08 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  29.01 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  28.39 
 
 		 484 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  28.39 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  29.4 
 
 		 376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  26.71 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  27.43 
 
 		 463 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  23.99 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  27.68 
 
 		 606 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  26.19 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  27.35 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 757 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>