32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1731 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  912    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  54.51 
 
 
456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  54.73 
 
 
456 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  52.95 
 
 
458 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  47.37 
 
 
456 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  46.49 
 
 
456 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  47.37 
 
 
456 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  46.27 
 
 
456 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  45.95 
 
 
457 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  46.07 
 
 
456 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  47.26 
 
 
457 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  46.72 
 
 
456 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  46.37 
 
 
455 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  47.17 
 
 
456 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  45.61 
 
 
456 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  44.42 
 
 
457 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  45.3 
 
 
457 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  43.52 
 
 
459 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  45.08 
 
 
457 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  45.08 
 
 
457 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  38.26 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  27.92 
 
 
460 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  31.67 
 
 
457 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  27.37 
 
 
484 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  27.37 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  28.77 
 
 
376 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  25.18 
 
 
458 aa  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  25.07 
 
 
469 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  26.27 
 
 
463 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  21.87 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  25.15 
 
 
606 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  33.67 
 
 
465 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>