32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2433 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  890    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  53.85 
 
 
459 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  48.9 
 
 
456 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  48.9 
 
 
456 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  49.67 
 
 
457 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  49.12 
 
 
456 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  48.79 
 
 
456 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  49.12 
 
 
456 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  49.34 
 
 
456 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  47.48 
 
 
457 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  48.9 
 
 
458 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  48.46 
 
 
456 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  47.59 
 
 
456 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  49.67 
 
 
457 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  44.96 
 
 
457 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  46.37 
 
 
456 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  47.81 
 
 
456 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  46.05 
 
 
456 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  46.49 
 
 
457 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  45.61 
 
 
457 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  38.24 
 
 
456 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  32.61 
 
 
457 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  30.8 
 
 
460 aa  200  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  30.75 
 
 
484 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  30.54 
 
 
484 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  26.81 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  30.51 
 
 
606 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  26.15 
 
 
376 aa  125  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  26.15 
 
 
463 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  24.63 
 
 
469 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  24.2 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  30.84 
 
 
465 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>