32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0534 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  100 
 
 		 456 aa  888    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  41.54 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  42.42 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  41.92 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  41.76 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  41.01 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  39.78 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  41.54 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  39.56 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  39.78 
 
 		 456 aa  340  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  39.56 
 
 		 456 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  38.24 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  39.04 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  38.6 
 
 		 457 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  38.26 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  39 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  37.8 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  36.48 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  37.34 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  38.68 
 
 		 457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  38.02 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  29.85 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  32.24 
 
 		 460 aa  186  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  28.39 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  28.12 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  33.43 
 
 		 469 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  28.85 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  27.66 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  27.01 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  26.77 
 
 		 606 aa  86.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  21.87 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  23.35 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>