32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1642 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  905    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  53.85 
 
 		 455 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  47.7 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  48.46 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  49.89 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  48.57 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  46.27 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  47.25 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  46.51 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  47.48 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  46.05 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  46.71 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  47.37 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  47.7 
 
 		 457 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  46.39 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  44.96 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  43.64 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  43.52 
 
 		 456 aa  362  6e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  45.83 
 
 		 457 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  45.39 
 
 		 457 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  37.34 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  34.64 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  29.67 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  31.18 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  30.97 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  27.74 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  25.93 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  30.36 
 
 		 606 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  27.03 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  22.97 
 
 		 463 aa  103  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  27.54 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  23.17 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>