31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1575 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  100 
 
 
469 aa  917    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  27.71 
 
 
458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  33.12 
 
 
463 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  27.53 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  27.53 
 
 
484 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  28.9 
 
 
456 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  27.43 
 
 
460 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  26.71 
 
 
456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  27.27 
 
 
456 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  28.73 
 
 
456 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  28.47 
 
 
457 aa  126  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  25.81 
 
 
456 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  29.46 
 
 
456 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  33.43 
 
 
456 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  25.16 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  25.74 
 
 
457 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  28.61 
 
 
459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  25.06 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  26.74 
 
 
457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  25.38 
 
 
457 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  23.99 
 
 
456 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  24.26 
 
 
456 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  22.48 
 
 
457 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  25.99 
 
 
457 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  24.63 
 
 
455 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  23.83 
 
 
457 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  25.07 
 
 
456 aa  101  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  26.96 
 
 
458 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  26.86 
 
 
606 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  22.14 
 
 
464 aa  77  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  23.03 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>