32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3200 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  100 
 
 		 456 aa  901    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  70.18 
 
 		 456 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  56.36 
 
 		 456 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  53.95 
 
 		 456 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  56.36 
 
 		 456 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  58.33 
 
 		 456 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  54.82 
 
 		 456 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  54.49 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  52.63 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  53.39 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  56.46 
 
 		 457 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  52.85 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  53.07 
 
 		 456 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  51.1 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  48.9 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  50.66 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  47.59 
 
 		 455 aa  405  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  50.22 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  45.61 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  44.96 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  41.92 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  34.34 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  29.54 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  29.31 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  29.53 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  32.53 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  29.18 
 
 		 469 aa  136  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  27.63 
 
 		 606 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  25.76 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  25.75 
 
 		 458 aa  99.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  24.25 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  27.73 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>