30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1130 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  760    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  28.82 
 
 
484 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  28.82 
 
 
484 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  27.74 
 
 
459 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  29.35 
 
 
456 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  31.98 
 
 
456 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  29.69 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  30 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  28.77 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  29.85 
 
 
456 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
457 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  27.59 
 
 
456 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  30.12 
 
 
456 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  27.25 
 
 
456 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  27.22 
 
 
460 aa  123  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  26.02 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  28.07 
 
 
457 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  26.83 
 
 
456 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  26.08 
 
 
456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  27.96 
 
 
457 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  26.15 
 
 
457 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  27.03 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  27.66 
 
 
456 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  24.18 
 
 
457 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  26.47 
 
 
457 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  23.91 
 
 
457 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  23.03 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  25.9 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  24.29 
 
 
606 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  20.72 
 
 
463 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>