32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2969 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  81.4 
 
 		 457 aa  727    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  98.25 
 
 		 457 aa  880    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  100 
 
 		 457 aa  888    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  65.79 
 
 		 456 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  65.13 
 
 		 456 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  65.35 
 
 		 456 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  64.91 
 
 		 456 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  60.53 
 
 		 456 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  51.42 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  51.54 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  50.11 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  51.2 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  52.85 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  50.44 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  50.66 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  48.9 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  46.27 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  48.04 
 
 		 458 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  45.83 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  45.08 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  39.47 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  36.62 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  25.98 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  27.56 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  27.78 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  27.55 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  25.14 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 606 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  25 
 
 		 463 aa  93.6  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  23.9 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  23.36 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  25.73 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>