32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2982 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2982  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  917    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2669  putative transmembrane protein  32.79 
 
 		 457 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1642  hypothetical protein  29.69 
 
 		 459 aa  206  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0763963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2433  hypothetical protein  30 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411494  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4161  hypothetical protein  29.36 
 
 		 456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404295  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1731  hypothetical protein  28.82 
 
 		 456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0534  putative transmembrane protein  32.24 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00817659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1898  hypothetical protein  31.67 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.807873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2075  hypothetical protein  28.75 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0022  putative transmembrane protein  28.45 
 
 		 456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5587  hypothetical protein  28.72 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5635  hypothetical protein  28.97 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1037  putative transmembrane protein  29.16 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0767  putative transmembrane protein  29.03 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0361429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2468  putative transmembrane protein  28.51 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1970  transmembrane protein  28.05 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.233998  normal  0.0408666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5540  putative transmembrane protein  28.45 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3200  putative transmembrane protein  29.54 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5284  putative transmembrane protein  26.6 
 
 		 456 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216251  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24560  hypothetical protein  27.99 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2270  hypothetical protein  28.01 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2079  hypothetical protein  28.79 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1832  putative transmembrane protein  26.44 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  hitchhiker  0.00163327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2969  putative transmembrane protein  26.28 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1497  putative transmembrane protein  26.28 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1575  membrane protein-like protein  27.43 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1130  hypothetical protein  27.22 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0993  membrane protein-like protein  29.33 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.643134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  26.63 
 
 		 606 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1620  membrane protein-like  23.68 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128399  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1422  hypothetical protein  26.09 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4077  hypothetical protein  23.91 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0336347  normal  0.0608819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>