More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0163 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0163  aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 158 aa  317  5e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  55.9 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  54.22 
 
 		 186 aa  150  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  53.01 
 
 		 186 aa  148  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 		 202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 		 202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.34 
 
 		 213 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.31 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.95 
 
 		 210 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  48.55 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 186 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  39.44 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.32 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 207 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 207 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 207 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 207 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 210 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 186 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 186 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 186 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 186 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.57 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  36.46 
 
 		 208 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.57 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  44.93 
 
 		 199 aa  114  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  39.76 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.52 
 
 		 183 aa  113  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 		 228 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  45.59 
 
 		 191 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.72 
 
 		 187 aa  111  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  38.37 
 
 		 196 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  40.46 
 
 		 365 aa  110  9e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  37.29 
 
 		 213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.97 
 
 		 190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  35.5 
 
 		 195 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  39.41 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  39.41 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  36.57 
 
 		 209 aa  107  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  39.88 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1451  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.53 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.810799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  39.26 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.85 
 
 		 206 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  34.5 
 
 		 193 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  39.29 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  37.35 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  39.53 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.79 
 
 		 195 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  42.17 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  38.67 
 
 		 190 aa  100  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  37.06 
 
 		 190 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  37.42 
 
 		 181 aa  100  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  34.91 
 
 		 217 aa  100  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  38.01 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  38.01 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.78 
 
 		 206 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  39.41 
 
 		 189 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  37.21 
 
 		 196 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  39.87 
 
 		 205 aa  98.2  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  43.07 
 
 		 190 aa  98.2  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2286  aminoacyl-tRNA hydrolase  32.35 
 
 		 194 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  38.27 
 
 		 181 aa  97.4  6e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 188 aa  97.8  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  40.85 
 
 		 191 aa  97.4  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  41.91 
 
 		 192 aa  97.8  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  34.52 
 
 		 201 aa  97.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  31.25 
 
 		 198 aa  97.1  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  33.9 
 
 		 201 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  38.76 
 
 		 202 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  45.8 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  38.65 
 
 		 186 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  38.82 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  34.55 
 
 		 191 aa  95.5  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 		 189 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  37.78 
 
 		 202 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 		 193 aa  94.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  42.97 
 
 		 189 aa  94  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  42.01 
 
 		 193 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  34.13 
 
 		 188 aa  93.2  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  34.52 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  36.59 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 206 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 200 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  34.97 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 239 aa  91.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  32.72 
 
 		 213 aa  91.3  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  32.54 
 
 		 214 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  34.73 
 
 		 219 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  37.28 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 		 196 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  36.65 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  39.64 
 
 		 193 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1586  lipoprotein  42.28 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>