More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2970 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  78.66 
 
 		 406 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  100 
 
 		 412 aa  830    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  69.98 
 
 		 421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  68.98 
 
 		 422 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  68.47 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  68.23 
 
 		 425 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  67.98 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  69.06 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  68.24 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  68.73 
 
 		 422 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  67.74 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  68.42 
 
 		 432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  67.49 
 
 		 422 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  68.98 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  69.23 
 
 		 422 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  68.98 
 
 		 422 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03522  NADP-dependent malic enzyme  65.51 
 
 		 411 aa  551  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002303  NADP-dependent malic enzyme  67.75 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.751894  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  69.13 
 
 		 407 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  67.57 
 
 		 414 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2745  NADP-dependent malic enzyme  66.75 
 
 		 415 aa  548  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4423  malate dehydrogenase  64.6 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00051  malate oxidoreductase  67.25 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  67.82 
 
 		 422 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4187  malate dehydrogenase  65.35 
 
 		 415 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0331  NADP-dependent malic enzyme, truncated  67.08 
 
 		 413 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0705  hypothetical protein  66.26 
 
 		 411 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0687  hypothetical protein  66.26 
 
 		 411 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3757  malate dehydrogenase  63.79 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0448  malate dehydrogenase  66.01 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4881  NADP-dependent malic enzyme, truncated  67.08 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43250  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  67 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413003  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3669  malic enzyme, NAD-binding  65.52 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0383  malate dehydrogenase  65.1 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2254  putative malate dehydrogenase  66.42 
 
 		 425 aa  532  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.966162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3353  malate dehydrogenase  64.04 
 
 		 412 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3492  malate dehydrogenase  65.27 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0460  malate dehydrogenase  65.27 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2051  NADP-dependent malic enzyme, truncated  65.34 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0244  malate dehydrogenase  66.33 
 
 		 401 aa  528  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0538  malate dehydrogenase  64.44 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4118  malate oxidoreductase, putative  64.29 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0554  malate dehydrogenase  64.29 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3774  malate dehydrogenase  65.59 
 
 		 416 aa  521  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3841  malate dehydrogenase  64.94 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0499  malate dehydrogenase  64.94 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0478  malate dehydrogenase  64.94 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0502  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  64.69 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  61.76 
 
 		 771 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2058  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  63.66 
 
 		 478 aa  502  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  61.52 
 
 		 749 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  61.52 
 
 		 749 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  62.06 
 
 		 780 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  61.92 
 
 		 752 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  61.56 
 
 		 779 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  61.18 
 
 		 752 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  60.78 
 
 		 759 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  60.78 
 
 		 751 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  62 
 
 		 760 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  61.15 
 
 		 757 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  61.6 
 
 		 759 aa  483  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  61.08 
 
 		 752 aa  481  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  59.85 
 
 		 761 aa  481  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  62.16 
 
 		 754 aa  481  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  59.75 
 
 		 762 aa  481  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  59.75 
 
 		 754 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  60.88 
 
 		 783 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  61.48 
 
 		 758 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  61.48 
 
 		 758 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  59.8 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  60.05 
 
 		 751 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  59.16 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  59.16 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  59.16 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  59.16 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  60.85 
 
 		 761 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  60.69 
 
 		 749 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  61.56 
 
 		 752 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  58.87 
 
 		 766 aa  474  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1298  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+)  59.25 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  59.16 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  59.75 
 
 		 751 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.37 
 
 		 755 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  58.17 
 
 		 759 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  61.35 
 
 		 763 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  61.31 
 
 		 752 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.11 
 
 		 757 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  61.14 
 
 		 751 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  59.02 
 
 		 754 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.06 
 
 		 759 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  60.85 
 
 		 761 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  59.06 
 
 		 759 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  59.06 
 
 		 759 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  59.06 
 
 		 759 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  60.49 
 
 		 773 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  62.25 
 
 		 764 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  59.06 
 
 		 759 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  56.55 
 
 		 779 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  59.06 
 
 		 759 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  57.92 
 
 		 759 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>