More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  80.92 
 
 		 414 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43250  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  100 
 
 		 414 aa  832    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  71.5 
 
 		 432 aa  622  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  72.51 
 
 		 422 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  73.72 
 
 		 422 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  72.51 
 
 		 425 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  72.51 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  72.22 
 
 		 421 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  72.02 
 
 		 425 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  73.48 
 
 		 422 aa  614  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  73.48 
 
 		 422 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  72.09 
 
 		 422 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  72.26 
 
 		 422 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  72.26 
 
 		 422 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  71.29 
 
 		 450 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  71.26 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002303  NADP-dependent malic enzyme  71.15 
 
 		 425 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.751894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  72.99 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00051  malate oxidoreductase  70.76 
 
 		 425 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03522  NADP-dependent malic enzyme  69.55 
 
 		 411 aa  588  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2745  NADP-dependent malic enzyme  69.66 
 
 		 415 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4187  malate dehydrogenase  69.23 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4423  malate dehydrogenase  66.67 
 
 		 415 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0383  malate dehydrogenase  68.13 
 
 		 415 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2254  putative malate dehydrogenase  70.59 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.966162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3757  malate dehydrogenase  66.67 
 
 		 415 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0331  NADP-dependent malic enzyme, truncated  67.97 
 
 		 413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4881  NADP-dependent malic enzyme, truncated  68.22 
 
 		 415 aa  559  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3841  malate dehydrogenase  67.56 
 
 		 414 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0502  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  67.32 
 
 		 414 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0499  malate dehydrogenase  67.56 
 
 		 414 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0478  malate dehydrogenase  67.56 
 
 		 414 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3669  malic enzyme, NAD-binding  67.32 
 
 		 414 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0554  malate dehydrogenase  67.57 
 
 		 414 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0460  malate dehydrogenase  67.07 
 
 		 414 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0448  malate dehydrogenase  67.64 
 
 		 415 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2051  NADP-dependent malic enzyme, truncated  67.24 
 
 		 413 aa  554  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4118  malate oxidoreductase, putative  68.07 
 
 		 414 aa  551  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3353  malate dehydrogenase  65.85 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3492  malate dehydrogenase  66.83 
 
 		 414 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  67 
 
 		 412 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0538  malate dehydrogenase  65.62 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3774  malate dehydrogenase  67.57 
 
 		 416 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  66.17 
 
 		 406 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0687  hypothetical protein  63.52 
 
 		 411 aa  512  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0705  hypothetical protein  63.52 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0244  malate dehydrogenase  63.16 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2058  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  62.35 
 
 		 478 aa  498  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  62.57 
 
 		 407 aa  494  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  60.05 
 
 		 752 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  59.5 
 
 		 780 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  59.8 
 
 		 760 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  59.7 
 
 		 754 aa  469  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  58.31 
 
 		 749 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  58.25 
 
 		 766 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  58.31 
 
 		 749 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  59.25 
 
 		 759 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  59.25 
 
 		 751 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  58.5 
 
 		 779 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  58 
 
 		 757 aa  467  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.07 
 
 		 771 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  58.31 
 
 		 752 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  56.62 
 
 		 759 aa  461  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  62.03 
 
 		 754 aa  458  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  59.06 
 
 		 749 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  57.21 
 
 		 762 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  58.15 
 
 		 758 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  57.82 
 
 		 752 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1298  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+)  57.11 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  57.07 
 
 		 754 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  56.97 
 
 		 759 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  57.21 
 
 		 761 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  56.54 
 
 		 769 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  56.72 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  58.46 
 
 		 752 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  58.6 
 
 		 758 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  57.96 
 
 		 763 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  58.6 
 
 		 758 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  57.78 
 
 		 751 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  56.72 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  58.5 
 
 		 751 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  56.72 
 
 		 759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  58.56 
 
 		 761 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  54.66 
 
 		 761 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  57.28 
 
 		 766 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.25 
 
 		 757 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  57.75 
 
 		 761 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2520  malate dehydrogenase  56.3 
 
 		 439 aa  448  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6438  normal  0.0151254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  57 
 
 		 754 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>