More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0279 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  47.31 
 
 		 759 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  47.37 
 
 		 759 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  49.14 
 
 		 752 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  45.92 
 
 		 759 aa  653    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  100 
 
 		 759 aa  1560    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  47.63 
 
 		 751 aa  656    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2959  malic enzyme  47.93 
 
 		 749 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  47.37 
 
 		 759 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  50.94 
 
 		 766 aa  764    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  51.34 
 
 		 763 aa  753    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  47.36 
 
 		 756 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  48.75 
 
 		 752 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  49.73 
 
 		 779 aa  710    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  51.53 
 
 		 761 aa  773    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  47.29 
 
 		 756 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  51.32 
 
 		 757 aa  756    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  53.83 
 
 		 754 aa  787    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  48.13 
 
 		 765 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  45.6 
 
 		 759 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  46.08 
 
 		 783 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  48.28 
 
 		 749 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  46.05 
 
 		 759 aa  655    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  47.69 
 
 		 756 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  47.37 
 
 		 759 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  48.67 
 
 		 752 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  46.97 
 
 		 759 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  52.58 
 
 		 755 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  46.83 
 
 		 756 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  47.87 
 
 		 771 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  49.93 
 
 		 752 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  46.43 
 
 		 779 aa  657    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  48.81 
 
 		 749 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  47.35 
 
 		 758 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2471  malic protein NAD-binding protein  47.76 
 
 		 751 aa  652    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  45.72 
 
 		 759 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  47.24 
 
 		 759 aa  665    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  47.11 
 
 		 759 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  46.68 
 
 		 756 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  45.72 
 
 		 759 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  47.37 
 
 		 759 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  47.35 
 
 		 758 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  48.54 
 
 		 773 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  47.11 
 
 		 759 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  49.47 
 
 		 749 aa  683    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  47.37 
 
 		 759 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  47.29 
 
 		 756 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  47.11 
 
 		 759 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  47.26 
 
 		 764 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  48.01 
 
 		 771 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  50.87 
 
 		 757 aa  755    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  47.42 
 
 		 749 aa  651    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  45.03 
 
 		 776 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  45.73 
 
 		 759 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  46.68 
 
 		 756 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  47.31 
 
 		 759 aa  667    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  46.18 
 
 		 759 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  51.34 
 
 		 771 aa  760    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  47.29 
 
 		 756 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  49.87 
 
 		 780 aa  712    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  47.24 
 
 		 759 aa  665    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  48.07 
 
 		 757 aa  666    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  47.11 
 
 		 759 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  46.58 
 
 		 759 aa  656    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  47.04 
 
 		 756 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  47.04 
 
 		 756 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  45.13 
 
 		 764 aa  634  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  47.04 
 
 		 756 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  45.59 
 
 		 759 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  47.04 
 
 		 756 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  47.04 
 
 		 773 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  47.04 
 
 		 756 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1580  malic enzyme  46.98 
 
 		 764 aa  632  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  47.04 
 
 		 756 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  47.04 
 
 		 756 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  45.66 
 
 		 758 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  45.97 
 
 		 761 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  47.47 
 
 		 771 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  45.18 
 
 		 779 aa  626  1e-178  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  45.84 
 
 		 759 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  45.84 
 
 		 751 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  46.11 
 
 		 763 aa  622  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  47.47 
 
 		 767 aa  624  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  45.5 
 
 		 760 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  45.18 
 
 		 777 aa  623  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  45.24 
 
 		 760 aa  622  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  46.6 
 
 		 755 aa  622  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  47.47 
 
 		 761 aa  620  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1525  malic enzyme  47.38 
 
 		 750 aa  615  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.875693  normal  0.0504681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  44.12 
 
 		 769 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  45.5 
 
 		 769 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6030  malic enzyme  46.77 
 
 		 769 aa  618  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1940  malic enzyme  46.58 
 
 		 773 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.5551  normal  0.0188499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  45.37 
 
 		 752 aa  612  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  47.15 
 
 		 753 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2263  malic enzyme  46.58 
 
 		 773 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  46.15 
 
 		 764 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3014  malic enzyme  45.9 
 
 		 751 aa  614  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  45.02 
 
 		 754 aa  615  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0498  malic enzyme  46.63 
 
 		 775 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423253  normal  0.484498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  46.61 
 
 		 760 aa  614  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>