More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0705 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0705  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  836    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0687  hypothetical protein  99.76 
 
 
411 aa  833    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  66.26 
 
 
412 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3757  malate dehydrogenase  66.26 
 
 
415 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  67.41 
 
 
421 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4423  malate dehydrogenase  64.78 
 
 
415 aa  545  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03522  NADP-dependent malic enzyme  65.59 
 
 
411 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  65.76 
 
 
450 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3353  malate dehydrogenase  64.29 
 
 
412 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4187  malate dehydrogenase  65.93 
 
 
415 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  67 
 
 
422 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  65.76 
 
 
422 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  65.26 
 
 
414 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  65.51 
 
 
422 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0554  malate dehydrogenase  65.02 
 
 
414 aa  534  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0383  malate dehydrogenase  65.27 
 
 
415 aa  529  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0499  malate dehydrogenase  65.02 
 
 
414 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  68 
 
 
406 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3841  malate dehydrogenase  65.02 
 
 
414 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  67.25 
 
 
422 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0478  malate dehydrogenase  65.02 
 
 
414 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3669  malic enzyme, NAD-binding  64.78 
 
 
414 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4118  malate oxidoreductase, putative  65.02 
 
 
414 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  66.75 
 
 
422 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  64.52 
 
 
425 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  64.34 
 
 
432 aa  527  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  64.52 
 
 
422 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0502  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  64.78 
 
 
414 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3492  malate dehydrogenase  64.53 
 
 
414 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0460  malate dehydrogenase  64.53 
 
 
414 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  67 
 
 
422 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  64.02 
 
 
422 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  64.02 
 
 
425 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  64.27 
 
 
425 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002303  NADP-dependent malic enzyme  64.18 
 
 
425 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.751894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0448  malate dehydrogenase  64.04 
 
 
415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  66.23 
 
 
422 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  64.38 
 
 
407 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0538  malate dehydrogenase  63.55 
 
 
415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00051  malate oxidoreductase  63.7 
 
 
425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3774  malate dehydrogenase  66.06 
 
 
416 aa  512  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2745  NADP-dependent malic enzyme  62.9 
 
 
415 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43250  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  64.49 
 
 
414 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0331  NADP-dependent malic enzyme, truncated  63.28 
 
 
413 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2051  NADP-dependent malic enzyme, truncated  63.09 
 
 
413 aa  500  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4881  NADP-dependent malic enzyme, truncated  63.61 
 
 
415 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2254  putative malate dehydrogenase  64.94 
 
 
425 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.966162  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0244  malate dehydrogenase  61.4 
 
 
401 aa  495  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2058  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  62.02 
 
 
478 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  60.2 
 
 
752 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  59.26 
 
 
766 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.85 
 
 
771 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  59.06 
 
 
749 aa  474  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  58.58 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.58 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  58.81 
 
 
749 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  58.58 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  58.58 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  59.65 
 
 
780 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  59.2 
 
 
752 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  58.58 
 
 
759 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  58.62 
 
 
759 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  57.49 
 
 
766 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  58.62 
 
 
759 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  59.4 
 
 
779 aa  471  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  58.58 
 
 
759 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  58.62 
 
 
759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  58.62 
 
 
759 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  58.58 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  58.62 
 
 
759 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  58.58 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  55.88 
 
 
779 aa  471  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  58.58 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  58.58 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  58.85 
 
 
754 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  58.02 
 
 
769 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1298  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+)  58.17 
 
 
440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  57.61 
 
 
764 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  58.13 
 
 
760 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  59.7 
 
 
752 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  55.64 
 
 
779 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  56.51 
 
 
757 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  57.88 
 
 
759 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  59.7 
 
 
749 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  55.88 
 
 
777 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  59.1 
 
 
754 aa  465  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  57.78 
 
 
756 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  57.88 
 
 
751 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  57.78 
 
 
756 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  57.78 
 
 
756 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  57.53 
 
 
756 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  56.9 
 
 
754 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  57.88 
 
 
751 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  56.3 
 
 
757 aa  461  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  56.16 
 
 
759 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  57.53 
 
 
756 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  56.79 
 
 
761 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  57.04 
 
 
756 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  56.54 
 
 
760 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  57.04 
 
 
756 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>