More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0824 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  79.47 
 
 
422 aa  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  100 
 
 
421 aa  855    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  79.71 
 
 
422 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  79.47 
 
 
422 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  80.91 
 
 
450 aa  711    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  79 
 
 
425 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  78.18 
 
 
422 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  79.43 
 
 
422 aa  672    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  79.47 
 
 
422 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  77.86 
 
 
432 aa  696    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  79.47 
 
 
425 aa  701    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  79.47 
 
 
422 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  79.47 
 
 
422 aa  706    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  79.24 
 
 
422 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  79.47 
 
 
425 aa  700    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43250  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  72.22 
 
 
414 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4423  malate dehydrogenase  74.13 
 
 
415 aa  615  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  69.08 
 
 
414 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4187  malate dehydrogenase  72.32 
 
 
415 aa  615  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002303  NADP-dependent malic enzyme  72.68 
 
 
425 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.751894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03522  NADP-dependent malic enzyme  70.86 
 
 
411 aa  608  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00051  malate oxidoreductase  72.68 
 
 
425 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2745  NADP-dependent malic enzyme  72.09 
 
 
415 aa  604  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3757  malate dehydrogenase  70.39 
 
 
415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2051  NADP-dependent malic enzyme, truncated  71.15 
 
 
413 aa  597  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3353  malate dehydrogenase  72.52 
 
 
412 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0383  malate dehydrogenase  72.26 
 
 
415 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0331  NADP-dependent malic enzyme, truncated  70.66 
 
 
413 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4881  NADP-dependent malic enzyme, truncated  71.46 
 
 
415 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  69.98 
 
 
412 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0448  malate dehydrogenase  70.8 
 
 
415 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4118  malate oxidoreductase, putative  72.21 
 
 
414 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0554  malate dehydrogenase  71.46 
 
 
414 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0460  malate dehydrogenase  70.8 
 
 
414 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3669  malic enzyme, NAD-binding  71.05 
 
 
414 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0478  malate dehydrogenase  70.8 
 
 
414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0499  malate dehydrogenase  70.8 
 
 
414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3841  malate dehydrogenase  70.8 
 
 
414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3492  malate dehydrogenase  71.71 
 
 
414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0502  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  70.56 
 
 
414 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3774  malate dehydrogenase  72.89 
 
 
416 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0538  malate dehydrogenase  71.22 
 
 
415 aa  578  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  69.14 
 
 
406 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2254  putative malate dehydrogenase  70.49 
 
 
425 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.966162  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0687  hypothetical protein  67.41 
 
 
411 aa  551  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0705  hypothetical protein  67.41 
 
 
411 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  65.31 
 
 
407 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2058  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  62.84 
 
 
478 aa  522  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384366  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0244  malate dehydrogenase  62.22 
 
 
401 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  64.5 
 
 
780 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  62.25 
 
 
759 aa  515  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  64.02 
 
 
752 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  63.75 
 
 
779 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  61.75 
 
 
771 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  62.25 
 
 
766 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  63.03 
 
 
752 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  63 
 
 
757 aa  507  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  60.93 
 
 
754 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  61.52 
 
 
749 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  65.5 
 
 
752 aa  501  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  63.28 
 
 
749 aa  501  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  61.76 
 
 
749 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  60.93 
 
 
760 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  61.33 
 
 
766 aa  499  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  60.88 
 
 
759 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  60.88 
 
 
759 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  61.25 
 
 
757 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  60.88 
 
 
759 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  59.95 
 
 
759 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  60.88 
 
 
759 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  60.88 
 
 
759 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  60.05 
 
 
752 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  59.95 
 
 
751 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  62.75 
 
 
752 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  59.56 
 
 
776 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  62.53 
 
 
761 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  60.64 
 
 
759 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  60.64 
 
 
759 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  60.64 
 
 
759 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  60.64 
 
 
759 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  60.29 
 
 
755 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  60.64 
 
 
759 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  61.69 
 
 
763 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  59.11 
 
 
763 aa  488  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  60.64 
 
 
759 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  60.64 
 
 
759 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  64.5 
 
 
754 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  60.64 
 
 
759 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  60.64 
 
 
759 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  60.65 
 
 
758 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  60.99 
 
 
763 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  60.64 
 
 
759 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  58.13 
 
 
769 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  60.45 
 
 
761 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  59.21 
 
 
757 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  60.1 
 
 
753 aa  488  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  60.99 
 
 
763 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  59.06 
 
 
754 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  64 
 
 
754 aa  485  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  63.28 
 
 
749 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>