More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0248 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  49.21 
 
 		 759 aa  722    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  49.21 
 
 		 759 aa  722    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  55.72 
 
 		 752 aa  829    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  54.38 
 
 		 773 aa  802    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  51.32 
 
 		 759 aa  756    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  49.87 
 
 		 759 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  46.89 
 
 		 756 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  48.2 
 
 		 773 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  50.13 
 
 		 781 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  49.33 
 
 		 759 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  48.01 
 
 		 771 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  49.21 
 
 		 759 aa  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  48.34 
 
 		 764 aa  709    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  49.73 
 
 		 759 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  47.02 
 
 		 774 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  46.89 
 
 		 756 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  50.13 
 
 		 759 aa  730    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  49.21 
 
 		 759 aa  722    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  56.86 
 
 		 749 aa  816    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  46.77 
 
 		 773 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  48.01 
 
 		 769 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  46.89 
 
 		 756 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  46.89 
 
 		 756 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2263  malic enzyme  47.94 
 
 		 773 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  58.01 
 
 		 763 aa  906    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  49.33 
 
 		 779 aa  696    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  46.18 
 
 		 759 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  49.21 
 
 		 758 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  49.46 
 
 		 777 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  48.22 
 
 		 774 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  46.54 
 
 		 763 aa  652    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  46.89 
 
 		 756 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  45.76 
 
 		 754 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  46.89 
 
 		 773 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  48.01 
 
 		 769 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  47.72 
 
 		 756 aa  670    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  49.28 
 
 		 783 aa  742    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  46.89 
 
 		 756 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  49.21 
 
 		 759 aa  722    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  47.15 
 
 		 774 aa  642    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  47.68 
 
 		 756 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  48.41 
 
 		 785 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  47.14 
 
 		 769 aa  664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  55.85 
 
 		 752 aa  834    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  46.44 
 
 		 757 aa  676    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  54.39 
 
 		 752 aa  795    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  58.94 
 
 		 766 aa  937    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  45.48 
 
 		 753 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  48.28 
 
 		 768 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  47.02 
 
 		 756 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  54.64 
 
 		 771 aa  808    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  47.42 
 
 		 756 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  48.6 
 
 		 754 aa  662    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  47.44 
 
 		 753 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  47.21 
 
 		 758 aa  654    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  49.21 
 
 		 759 aa  721    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  46.96 
 
 		 769 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  46.97 
 
 		 769 aa  652    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  47.55 
 
 		 756 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  49.33 
 
 		 759 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  49.73 
 
 		 759 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0599  malic enzyme  48.28 
 
 		 780 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  47.94 
 
 		 760 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  47.37 
 
 		 779 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  47.35 
 
 		 772 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  48.01 
 
 		 769 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2754  malic enzyme  48.41 
 
 		 780 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223736  normal  0.851039 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  48.01 
 
 		 769 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  47.94 
 
 		 760 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  49.33 
 
 		 777 aa  696    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  49.07 
 
 		 773 aa  680    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  49.33 
 
 		 759 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0556  malic enzyme  48.67 
 
 		 780 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  46.38 
 
 		 764 aa  661    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  47.12 
 
 		 754 aa  649    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  48.28 
 
 		 785 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  47.55 
 
 		 756 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  46.25 
 
 		 764 aa  659    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  47.44 
 
 		 770 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2604  malic enzyme  48.16 
 
 		 764 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0461756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  60.88 
 
 		 757 aa  934    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  49.28 
 
 		 755 aa  685    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0498  malic enzyme  47.54 
 
 		 775 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423253  normal  0.484498 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  46.89 
 
 		 756 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  49.54 
 
 		 776 aa  735    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  48.01 
 
 		 769 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  49.13 
 
 		 759 aa  707    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  48.19 
 
 		 769 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  47.58 
 
 		 756 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  48.67 
 
 		 766 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  47.95 
 
 		 761 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  48.81 
 
 		 779 aa  701    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  47.55 
 
 		 756 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  48.28 
 
 		 785 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  57.14 
 
 		 752 aa  813    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  54.06 
 
 		 757 aa  767    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  48.01 
 
 		 769 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  45.78 
 
 		 763 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  47.71 
 
 		 766 aa  684    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3013  malic enzyme  49.87 
 
 		 781 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>