More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3291 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  49.4 
 
 
759 aa  678    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  49.27 
 
 
759 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  50.67 
 
 
752 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  49.93 
 
 
759 aa  683    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  51.35 
 
 
752 aa  721    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  49 
 
 
756 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  51.55 
 
 
749 aa  718    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  49 
 
 
773 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  49.13 
 
 
759 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  75.87 
 
 
753 aa  1110    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  49.2 
 
 
766 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  49 
 
 
756 aa  658    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  48.25 
 
 
757 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  51.62 
 
 
752 aa  696    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1033  malic enzyme  48.79 
 
 
769 aa  642    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  49 
 
 
756 aa  658    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  49.93 
 
 
758 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  49.8 
 
 
773 aa  682    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  50.33 
 
 
749 aa  691    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  48.79 
 
 
769 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  49.86 
 
 
756 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  59.7 
 
 
764 aa  879    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  49 
 
 
756 aa  658    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  48.92 
 
 
771 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  49 
 
 
756 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  58.61 
 
 
751 aa  877    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  47.78 
 
 
779 aa  644    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2328  malic enzyme  47.23 
 
 
775 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  46.6 
 
 
758 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  48.51 
 
 
777 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1525  malic enzyme  49.06 
 
 
750 aa  640    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.875693  normal  0.0504681 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  55.75 
 
 
763 aa  847    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  49 
 
 
756 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  51.67 
 
 
749 aa  733    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  49 
 
 
773 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  49.79 
 
 
765 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0029  malic enzyme  59.33 
 
 
761 aa  867    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000328842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  49.6 
 
 
783 aa  666    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  61.28 
 
 
763 aa  906    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  58.61 
 
 
759 aa  887    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  49.24 
 
 
769 aa  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  48.73 
 
 
756 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  49.27 
 
 
759 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  49.93 
 
 
759 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  50.67 
 
 
752 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  48.73 
 
 
756 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  49 
 
 
756 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  46.77 
 
 
766 aa  642    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  59.12 
 
 
752 aa  884    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  61.65 
 
 
753 aa  917    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  49.93 
 
 
759 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  49.13 
 
 
756 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  49.19 
 
 
771 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  49.13 
 
 
759 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  100 
 
 
754 aa  1534    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0420  malic enzyme  50.13 
 
 
750 aa  686    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  55.38 
 
 
758 aa  840    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  59.12 
 
 
754 aa  898    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  49.27 
 
 
759 aa  676    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  49.13 
 
 
759 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  49.27 
 
 
759 aa  676    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2263  malic enzyme  49.47 
 
 
773 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828164  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  59.68 
 
 
761 aa  882    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  49.27 
 
 
759 aa  676    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  48.19 
 
 
760 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  48.33 
 
 
761 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  49.27 
 
 
759 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  49.46 
 
 
764 aa  677    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  49.27 
 
 
759 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1580  malic enzyme  49.87 
 
 
764 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  49.13 
 
 
759 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  47.64 
 
 
777 aa  637    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  47.02 
 
 
773 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  48.38 
 
 
769 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  49 
 
 
759 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  58.18 
 
 
751 aa  863    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  76.36 
 
 
754 aa  1138    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  48.46 
 
 
760 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  48.87 
 
 
756 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  49 
 
 
756 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  46.25 
 
 
769 aa  639    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  59.7 
 
 
761 aa  874    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  47.94 
 
 
757 aa  673    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  49.66 
 
 
755 aa  665    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  61.24 
 
 
754 aa  926    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  49.33 
 
 
771 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  46.58 
 
 
776 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  58.74 
 
 
751 aa  889    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  57.18 
 
 
758 aa  807    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  60.83 
 
 
761 aa  865    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  49.86 
 
 
756 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  49.13 
 
 
759 aa  673    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  48.79 
 
 
779 aa  657    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  48.61 
 
 
763 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  48.87 
 
 
756 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  60.11 
 
 
762 aa  899    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  52.16 
 
 
779 aa  731    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5338  malic enzyme  49.6 
 
 
761 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  49.8 
 
 
759 aa  673    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  60.61 
 
 
763 aa  897    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>