More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2378 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  78.66 
 
 		 412 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  100 
 
 		 406 aa  819    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  68.47 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  69.14 
 
 		 421 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  68.83 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  69.08 
 
 		 450 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  68.83 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  68.83 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  68.83 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  69.95 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  68.58 
 
 		 422 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  69.33 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  68.41 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  68.83 
 
 		 422 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  68.58 
 
 		 422 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  68.56 
 
 		 422 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  69.83 
 
 		 422 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4187  malate dehydrogenase  66.5 
 
 		 415 aa  551  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  69.33 
 
 		 407 aa  548  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  66.67 
 
 		 414 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4423  malate dehydrogenase  65.17 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3757  malate dehydrogenase  66.25 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0460  malate dehydrogenase  67.49 
 
 		 414 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3669  malic enzyme, NAD-binding  67.74 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2745  NADP-dependent malic enzyme  65.43 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03522  NADP-dependent malic enzyme  63.43 
 
 		 411 aa  535  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00051  malate oxidoreductase  65.91 
 
 		 425 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3492  malate dehydrogenase  67.49 
 
 		 414 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0331  NADP-dependent malic enzyme, truncated  65.09 
 
 		 413 aa  532  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0554  malate dehydrogenase  66.75 
 
 		 414 aa  534  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0705  hypothetical protein  68 
 
 		 411 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0687  hypothetical protein  68 
 
 		 411 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002303  NADP-dependent malic enzyme  64.76 
 
 		 425 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.751894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3353  malate dehydrogenase  65.1 
 
 		 412 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4118  malate oxidoreductase, putative  66.25 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0502  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  67.25 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0478  malate dehydrogenase  67.49 
 
 		 414 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0383  malate dehydrogenase  66.67 
 
 		 415 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3841  malate dehydrogenase  67.49 
 
 		 414 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0499  malate dehydrogenase  67.49 
 
 		 414 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0448  malate dehydrogenase  66.92 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2051  NADP-dependent malic enzyme, truncated  64.34 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4881  NADP-dependent malic enzyme, truncated  65.09 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43250  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  66.17 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0538  malate dehydrogenase  65.92 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2058  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  66.67 
 
 		 478 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384366  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0244  malate dehydrogenase  65.24 
 
 		 401 aa  522  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3774  malate dehydrogenase  65.67 
 
 		 416 aa  512  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2254  putative malate dehydrogenase  63.52 
 
 		 425 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.966162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  62.32 
 
 		 754 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  61.33 
 
 		 759 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  60.84 
 
 		 762 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  61.33 
 
 		 751 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  62.34 
 
 		 752 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  61.85 
 
 		 760 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  61.1 
 
 		 752 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  60.29 
 
 		 759 aa  481  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  61.35 
 
 		 754 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  60.49 
 
 		 754 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  58.48 
 
 		 759 aa  478  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  60.29 
 
 		 759 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  60.29 
 
 		 759 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.5 
 
 		 771 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  60.29 
 
 		 759 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  60.05 
 
 		 749 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  60.29 
 
 		 759 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  60.05 
 
 		 749 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  60.29 
 
 		 759 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  60.1 
 
 		 752 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  60.55 
 
 		 758 aa  474  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  61 
 
 		 761 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  60.85 
 
 		 761 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  60.4 
 
 		 780 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  59.8 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.8 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  59.8 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  59.8 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  61.15 
 
 		 749 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  58.33 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  60 
 
 		 753 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1298  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+)  57.61 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  59.8 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  60.84 
 
 		 751 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  59.8 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  58.72 
 
 		 766 aa  474  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  59.8 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  61.14 
 
 		 763 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  59.8 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  59.8 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0488  NADP-dependent malic enzyme  61.94 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  60.6 
 
 		 761 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  59.71 
 
 		 766 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  58.33 
 
 		 759 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  59.4 
 
 		 779 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  57.78 
 
 		 769 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  60.89 
 
 		 763 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  61.35 
 
 		 751 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  58.96 
 
 		 758 aa  465  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  57.99 
 
 		 760 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  57.99 
 
 		 756 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>