148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0020 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_R0020  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0183484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0057  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0003  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.300151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0017  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0008  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_003295  RS01506  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732279  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0040  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0920487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3032  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0039  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000122131  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0547169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1602  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0710124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0024  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0700552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0215661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0799224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0030  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0191215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2621  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0778487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0058  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0992  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2927  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2989  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.920581  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0155  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0062  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269971  normal  0.0642327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0040  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0088  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0055  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0032  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0044  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.1121e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0057  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.590224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0032  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t14  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607028  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0055  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.756499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0032  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571749  normal  0.068685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0010  tRNA-Ala  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.560104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0760  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0931  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0072  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.916606  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0054  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0042  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0024  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0031  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0040  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4318  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0003  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0045  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0302111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0003  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.203261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0008  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0042  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0040  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000293761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0016  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0485613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0049  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000556498  normal  0.485056 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0015  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0009  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 67 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0039  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.744114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00767918  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt14  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt14  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0021  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00000256576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0048  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000131085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0021  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0016  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192488  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2230  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0047  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.424478 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>