34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0057 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.590224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0055  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.756499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571749  normal  0.068685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0003  tRNA-Thr  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.300151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0020  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0024  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0020  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0007  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0040  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0802458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0054  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0020  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0183484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0041  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309363  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0059  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309120  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.15103  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.672407  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.231907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110849  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309069  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309187  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309288  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0313014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309145  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0009  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0475152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>