15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0020 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_R0020  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  92.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0003  tRNA-Thr  91.07 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.300151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0055  tRNA-Thr  90.91 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.756499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0032  tRNA-Thr  90.74 
 
 
72 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0032  tRNA-Thr  90.74 
 
 
72 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571749  normal  0.068685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0020  tRNA-Thr  89.09 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0041  tRNA-Thr  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0057  tRNA-Thr  92.68 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.590224  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0024  tRNA-Thr  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0044  tRNA-Thr  85.45 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00954192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0046  tRNA-Thr  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0059  tRNA-Thr  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000197967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>