32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Thr-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0017  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0029  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0055  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.756499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0020  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0183484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0033  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.076955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0032  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571749  normal  0.068685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0057  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.590224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0032  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0016  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0049  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0013  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00037699  normal  0.0920861 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0023  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.731836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>