27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0023 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.731836  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13110  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0488167  normal  0.646736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0022  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000850812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0022  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000177446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0042  tRNA-Arg  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00669255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0037  tRNA-Arg  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000548287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0031  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.745897  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0006  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26100  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01900  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0006  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0483173  normal  0.730879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14043  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0938748  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0006  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0020  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0817304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>